Ο Τομέας Πολιτικής Κοινωνιολογίας και Συγκριτικής πολιτικής
περιλαμβάνει τα πεδία της ανάλυσης των πολιτικών κομμάτων και των συλλογικών δράσεων, της πολιτειολογίας και του δημόσιου δικαίου, της πολιτικής συμπεριφοράς, των δημόσιων πολιτικών, της πολιτικής οικονομίας και της οικονομικής πολιτικής, των διεθνών σχέσεων, της πολιτικής επικοινωνίας αλλά και την μεθοδολογία έρευνας της Πολιτικής Επιστήμης.
Το Κέντρο Πολιτικών Ερευνών και το Εργαστήριο Συγκρουσιακής Πολιτικής λειτουργούν στο πλαίσιο του Τομέα συνεργαζόμενα με καθιερωμένους και νεότερους επιστήμονες και διεθνή ερευνητικά δίκτυα. Πραγματοποιούν ερευνητικά έργα, οργανώνουν συνέδρια και προσφέρουν συστηματικά σεμινάρια μεθοδολογίας.
Ο Τομέας Νεότερης Ιστορίας
περιλαμβάνει τα πεδία της Νεότερης και Σύγχρονης ευρωπαϊκής, ελληνικής, βαλκανικής, οθωμανικής ιστορίας, την ιστορία των μεταναστεύσεων, της ελληνικής διασποράς, των μειονοτήτων, της δημόσιας ιστορίας και της ιστοριογραφίας.
Στο πλαίσιο του Τομέα λειτουργεί το Κέντρο Έρευνας Νεότερης Ιστορίας (ΚΕΝΙ) με πέντε ερευνητικές μονάδες που καταγράφει σημαντικό πρωτογενές υλικό, συμμετέχει σε ευρωπαϊκά προγράμματα και υποδέχεται ερευνητές/τριες.
Ο Τομέας Κοινωνικής και Πολιτικής Θεωρίας
περιλαμβάνει τα πεδία της Κοινωνικής και Πολιτικής Θεωρίας, της Πολιτικής Φιλοσοφίας, της Πολιτικής Φιλοσοφίας της Δημοκρατικής Πολιτείας, τις εκδοχές και κριτικές της κατηγορίας της Προόδου, τα Μοντέλα Δημοκρατίας και τις Θεωρίες Δικαιοσύνης.
